【2回戦】 2017年7月16日（日）
| 時間 | 一塁側 | スコア | 三塁側 |
| サーティーフォー保土ヶ谷球場 | |||
| 11:00 | 星槎国際湘南 | 6-0 | 上矢部 |
| 13:30 | アレセイア | 2-8 | 麻布大付 |
| バッティングパレス相石スタジアムひらつか | |||
| 11:00 | 慶應義塾 | 4-0 | 相模原総合 |
| 13:30 | 光明相模原 | 10-0 | 新城 |
| 大和スタジアム | |||
| 11:00 | 大和南 | 1-4 | 市ケ尾 |
| 13:30 | 川崎工科 | 2-11 | 日大 |
| サーティーフォー相模原球場 | |||
| 11:00 | 橘学苑 | 5-6 （延長10回） |
逗葉 |
| 13:30 | 松陽 | 12-6 | 大楠 |
| 横須賀スタジアム | |||
| 11:00 | 山北 | 6x-5 | 秦野 |
| 13:30 | 綾瀬 | 7-2 | 磯子工業 |
| 藤沢八部球場 | |||
| 11:00 | 釜利谷 | 0-24 | 立花学園 |
| 13:30 | 光陵 | 4-6 | 藤沢清流 |
| 秦野カルチャーパーク野球場 | |||
| 11:00 | 関東六浦 | 3-13 | 伊志田 |
| 13:30 | 麻溝台 | 8-9 | 秦野総合 |
| 小田原球場 | |||
| 11:00 | 霧が丘 | 0-1x （延長10回） |
桜丘 |
| 13:30 | 舞岡 | 8x-7 （延長11回） |
横浜緑ヶ丘 |
| いせはらサンシャイン・スタジアム | |||
| 11:00 | 高津 | 4-5x | 城郷 |
| 13:30 | 市川崎 | 1-8 | 磯子 |
| 俣野公園横浜薬大スタジアム | |||
| 11:00 | 三浦学苑 | 5-2 | 慶応藤沢 |
| 13:30 | 横須賀学院 | 3-0 | 平塚湘風 |
第99回全国高校野球選手権神奈川大会 組み合わせ
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◎第1シード ○第2シード △第3シード ☆選手宣誓
◎第1シード ○第2シード △第3シード ☆選手宣誓
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